Τη διαφωνία του, με τον άλλοτε καθηγητή του στο Συνταγματικό Δίκαιο, Νίκο Αλεβιζάτο, για την παράκαμψη της Προανακριτικής Επιτροπής στην υπόθεση του εγκλήματος των Τεμπών εξέφρασε ο Θέμης Σοφός κατά τη διάρκεια της συνέντευξης που έδωσε στην τηλεοπτική Vicky Pedia της Βασιλικής Πολύζου. Ο διακεκριμένος νομικός και καθηγητής Ποινικού Δικαίου στο πανεπιστήμιο της Βόννης εξήγησε ότι “δεν νοείται το Δικαστικό Συμβούλιο να απαγγείλει κατηγορία σε άλλον υπουργό ή υφυπουργό χωρίς την άδεια της Βουλής” και διερωτήθηκε: “πώς θα το κάνει το συμβούλιο αυτό; Πρέπει να κάνει να στείλει αίτημα και να γίνει αποδεκτό από την πλειοψηφία στην ολομέλεια και μετά να…”.
Με ξεκάθαρο σκεπτικό, ο πρώην Αντιπρόεδρος του Δικηγορικού Συλλόγου Αθηνών διευκρίνισε ότι “αν δεν υπάρχει πόρισμα Προανακριτικής Επιτροπής, που να ορίζει ποια είναι τα πρόσωπα τα οποία πρέπει να παραπεμφθούν στη δικαιοσύνη, αν δεν υπάρχει πόρισμα το οποίο θα έχει εξετάσει όλα τα στοιχεία, ποιος θα το κάνει; Το Συμβούλιο; Το Συμβούλιο θα ενεργήσει πράξεις στη συνέχεια οι οποίες ανήκουν πολιτειακά, συνταγματικά σε άλλο όργανο; Αυτό είναι ανήκουστο. Αυτό είναι εσφαλμένο. Και βεβαίως υπάρχουν άλλοι συνταγματολόγοι, οι οποίοι προφανώς έχουν εκφράσει την άποψή τους και τάσσονται υπέρ της άποψης ότι πρέπει να προηγηθεί η διαδικασία της Προανακριτικής Επιτροπής”.
Με την ευθύτητα που τον χαρακτηρίζει και χωρίς να στρογγυλεύει τον λόγο του, ο Θέμης Σοφός άσκησε σκληρή κριτική και στον Γιώργο Φλωρίδη. Με την κρυστάλλινη άποψη ότι “ο υπουργός Δικαιοσύνης προσβάλλει τη Δικαιοσύνη” επειδή “δεν νοείται υπουργός της Δικαιοσύνης, της ελληνικής κυβέρνησης να προαναγγέλλει ανακριτικές πράξεις. Δεν νοείται υπουργός Δικαιοσύνης να μάς λέει πότε θα φέρει το πόρισμα το Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο”.